اخبار علمی

Safe-SeqS

مردم ممکن است فکر کنند که گردش DNA بدون سلول (cfDNA) کشف جدیدی است. ایویین دولامینک دکترا دانشگاه کرنل می گوید: “اینطور نیست ، cfDNA در واقع در دهه 1940 ، حتی قبل از ساختار DNA دو رشته ای کشف شد و با ظهور ژنومیک و فناوری های مولکولی ، ناگهان کاربردها بسیار مهم آن شناسایی شد. ” دکتر De Vlaminck اظهار داشت: طی فرآیند آپوپتوز یا فرآیندهای نابجا مرگ سلول ، اجزای سلول های مرده به طور جادویی ناپدید نمی شوند بلکه تکه های باقیمانده و ژنوم آنها می توانند وارد جریان خون شوند. cfDNA اساساً DNA ای است که در خون شناور است و داخل سلول ها وجود ندارد آنها در اصل بقایای سلول های مرده هستند. برنامه های کاربردی سرطان cfDNA از جمله مواردی هستند که در آستانه ورود به جریان اصلی بالینی هستند. مقادیر قابل توجهی cfDNA مخصوص تومور در جریان خون بیماران و سایر مایعات بیولوژیکی مانند ادرار یافت می شود. فن آوری های cfDNA سرطان متکی بر تشخیص جهش هایی هستند که به طور تعریف شده فقط در سلول های تومور وجود دارند و نه در سلول های طبیعی. مهمترین بخش دردرمان سرطان تشخیص زودهنگام آن است و دانشمندان امیدوارند cfDNA در تشخیص زودهنگام سرطانها کمک کند .نکته احتمالی این است که هرچه تومور در بیمار کوچکتر باشد ، تشخیص آن در بیوپسی مایع سخت تر است ، به این معنی که تشخیص زودهنگام معادل یافتن سوزن در انبار کاه است. دکتر پاپادوپولوس گفت: “هنگامی که فقط 1 تا 5 قطعه DNA تومور جهش یافته در دریایی از 10000 قطعه DNA وجود داشته باشد ، این یک چالش فنی است.”برای پاسخگویی به این چالش ، جان هاپکینز سیستم تعیین توالی ایمن (Safe-SeqS) را توسعه داد. وی افزود Safe-SeqS توسط PapGeneمجوز گرفته است تا کار خود را در زمینه تشخیص زودهنگام سرطان تخمدان و اندومتر انجام دهد. دکتر پاپادوپولوس خاطرنشان کرد: “مهمترین جنبه این فناوری این است که هر مولکول در اولین مرحله از فرآیند با یک بارکد مولکولی خاص ، یک شناسه منحصر به فرد (UID) مرتبط است.” هر آغازگر بارکد مولکولی مخصوص به خود را دارد. اگر 1000 نمونه مختلف KRAS در بیوپسی مایع وجود داشته باشد ، 1000 UIDمختلف برای KRAS وجود خواهد داشت. بارکد ها Safe-SeqS را بسیار حساس می کنند. یک مولکول جهش یافته را می توان در بین 10 هزار مولکول از نوع وحشی تشخیص داد و با کمک تکنیک NGS صدها جهش مختلف در صدها بیمار را می توان به طور همزمان تجزیه و تحلیل کرد

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *