توضیحات
زبان برنامه نویسی R
R یک زبان برنامهنویسی و نرم افزار رایگان است که توسط «راس ایهاکا» (Ross Ihaka) و «رابرت جنتلمن» (Robert Gentleman) در سال 1993 تهیه شده است.
R دارای کتابخانههای گستردهای از انواع روشهای آماری و شیوههای ترسیم نمودارها است. در این زبان برنامه نویسی، «الگوریتمهای یادگیری ماشین» (Machine Learning Algorithm)، «رگرسیون خطی» (Linear Regression)، «سریهای زمانی» (Time Series) و «استنباط آماری» (Statistical Inference) قابل استفاده هستند.
بیشتر «کتابخانههای» (Library) یا «بستههای» (Package) قابل دسترس در R، با خود زبان برنامه نویسی R نوشته شدهاند، اما برای کارهای محاسباتی سنگین، کدهایی به زبانهای C++ ،C و Fortran
نیز قابل دسترس بوده و کتابخانههایی با این زبانها، نوشته شدهاند.
زبان برنامهنویسی R نه تنها در بین دانشگاهیان و محققین مورد اقبال قرار گرفته است، بلکه بسیاری از شرکتهای بزرگ نیز از زبان برنامه نویسی R استفاده میکنند. در این بین میتوان به شرکتهایی
مانند Uber ،Google ،Airbnb و Facebook اشاره کرد.
سرفصل و محتوا:
دوره ی پیشرفته ی ۳ : GEO
جلسه ی اول ◀ آشنایی با پایگاه های داده ای و دیتابیس GEO [ حدود ۲ ساعت ]
✅ معرفی و نحوه ی سرچ در GEO
✅ آشنایی با پلتفورم ها
✅ آشنایی با GEO2R
✅ آشنایی با داده های GEO
جلسه ی دوم ◀ گرفتن داده از GEO با استفاده از R studio [ یک ساعت و نیم ]
✅ معرفی پکیج های مورد نیاز مرتبط با GEO
(limma,GEOquery,Biobase)
✅ کد نویسی های مربوط به دانلود داده ها
جلسه ی سوم ◀ توضیحات تئوری داده های نرمالایز شده و خام [ یک ساعت و نیم ]
✅ نرمالایز شدن و فیلتراسیون داده ها
✅ DEG و تفاوت بیان ها
✅ logFC و p.value
✅ گروه بندی کردن سمپل ها
جلسه ی چهارم ◀ normalization and filteration در R [ ۲ ساعت ]
✅ کدنویسی های نرمال کردن داده ها
✅ کدنویسی های فیلتر کردن داده ها
✅ بررسی نرمالایز داده ها با voom plot
✅ نحوه ی DEG گرفتن
جلسه ی پنجم ◀ آنالیز داده های Affymetrix [ یک ساعت و نیم ]
✅ معرفی پکیج های مورد نیاز
✅ کدنویسی های مربوطه
✅ آماده کردن جدول Excel
جلسه ی ششم ◀ annotation و آنالیز داده های Illumina [یک ساعت و45دقیقه]
✅ کدنویسی های گرفتن داده
✅ آماده کدن جدول داده ها در Excel
✅ کدنویسی های مربوطه
جلسه ی هفتم ◀ single Channel data limma [ یک ساعت و 45 دقیقه ]
✅ معرفی داده های تک کاناله در GEO
✅ آماده کردن داده ها
✅ کدنویسی های مربوطه
جلسه ی هشتم ◀ dual channel data limma [ یک ساعت و 45 دقیقه ]
✅ معرفی دیتای دو کاناله در GEO
✅ کدنویسی های مربوطه

نقد و بررسیها
هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.