توضیحات
آموزشگاه ژن فن آوری اوژن (تکوین ) مفتخر است با در اختیار داشتن امکانات و تجهیزات آزمایشگاهی و فضای مناسب آموزشی و اساتید مجرب و باتجربه در زمینه آموزش کارآموزان و دانشجویان محترم دوره طراحی پرایمر و اصول PCR برگزار کند.
ویژگی های این دوره:
تدریس عملی و تئوری مباحث
انجام تکنیک توسط خود کارآموز
ارائه مدرک بین المللی قابل ترجمه
برگزاری کلاس ها به صورت نیمه خصوصی(۴ تا ۵ نفره)
زمانبدی کلاسها با توجه به وقت و زمان کارآموز
پرایمرها مهمترین جزء در واکنش های PCR هستند.
اگر طراحی و سنتز پرایمرها مشکلی داشته باشد، دو حالت ایجاد می شود:
1. واکنش PCR انجام نمی شود
2. واکنش PCR اشتباه انجام می شود.
بنابراین طراحی پرایمر اولین مرحله انجام مطالعه دقیق مولکولی محسوب می شود و از اهمیت بسیار زیادی برخوردار است.
همانطور که می دانید واکنش PCR در محیط In Vitro برای تکثیر قسمتی از DNA انجام میشود. بنابراین برای بررسی مولکولی با اختصاصیت و حساسیت بالا، دسترسی به توالی دقیق و بدون نقص DNA از مسائل مهم و ریشه ای در طراحی پرایمر می باشد.
اصول طراحی پرایمر
- طول پرایمر(Primer) : بطور میانگین باید بین 18-25 جفت باز باشد. البته در بعضی از شرایط این اندازه کمتر و بیشتر هم می شود.
- درصد GC: پرایمرهای فوروارد و ریورس نزدیک هم باشد که در حالت ایده آل حدود 45-55 درصد می باشد.
- آزاد بودن سر 3 پریم: پرایمرهای فوروارد و ریورس نباید در سر 3 پریم، دارای بازهای G و C باشند.
- مکمل نباشند: پرایمرهای فوروارد و ریورس نباید مکمل همدیگر باشند. زیرا باعث تولید پرایمر دایمر می شود.
- توالی تکراری سر 3 پریم: پرایمرهای فوروارد و ریورس باید دارای توالی تکراری غیر مکمل یکدیگر داشته باشند.
- دمای TM پرایمرها: دمای TM (Melting Temperature) پرایمرها باید نزدیک به یکدیگر باشند. اختلاف TM دو پرایمر باید کمتر از 2 و در حالت ایده آل صفر باشد.
- دمای TA پرایمرها: دمای TA (Annealing Temperature) پرایمرها باید نزدیک به یکدیگر باشند.
- طول محصول PCR: طول محصول PCR برای مطالعات مختلف متفاوت است. معمولا حدود 70 تا800 جفت باز طول دارند که بهترین محصول را برای مطالعات مختلف می شود در این بازه مشاهده کرد. مثلا برای Real time PCR طول محصول بین 70 تا 120 جفت باز بهترین حالت است.
Gene Data Base
به دلیل افزایش سریع در داده های زیستی در زمینه های مختلف مانند: مقالات، ثبت اختراعات، گزارش ها، توالی های نوکلئوتیدی یا اسید آمینه ای، ساختار سه بعدی، بررسی های ژل الکتروفورز و … ایجاد پایگاه های زیستی ضرورت یافته است.
سه پایگاه معتبر برای حفظ و ذخیره اطلاعات نوکلئوتیدی وجود دارد:
- GenBank در آمریکای شمالی
- EMBL در اروپا
- DDBJ در آسیا
یکی از اولین پایگاه ها GenBank می باشد، که در سال 1982 میلادی با تنها 5 توالی شروع شد. اما امروزه بیش از 100 میلیون اطلاعات در آن به ثبت رسیده است.
برای طراحی پرایمر در قدم اول باید توالی اسید نوکلئیک را از دیتا بانک استخراج و طراحی پرایمر را بر روی آن انجام داد.
برای اینکه راحت تر کار را لمس کنید مثالی را برای بررسی بیان ترانسکریپت ژن BCL2 برای روش RT-PCR با هم انجام می دهیم.
برای این کار وارد سایت https://www.ncbi.nlm.nih.gov می شویم و ژن مورد نظر را پیدا را جستجو و گزینه Gene را انتخاب می کنیم.
نقد و بررسی‌ها
هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.